Пан-геном маша выявил более 100 000 структурных вариантов
Материал подготовлен искусственным интеллектом на основе нескольких источников — ссылки на оригиналы приведены ниже.
Исследователи из Центра инноваций в области сельскохозяйственных культур и продовольствия (CCFI) опубликовали в Nature Genetics первый в мире графовый пан-геном маша, выявив более 100 000 ранее скрытых структурных вариантов. Ресурс определяет генетические варианты, связанные с ключевыми агрономическими признаками, такими как размер семян, количество стручков и устойчивость к стрессу. Это открытие может ускорить программы селекции зернобобовой культуры, важной для продовольственной безопасности в Азии и Африке.
Ресурс пан-генома
Исследование, опубликованное в Nature Genetics 10 июля 2026 года, представляет графовый пан-геном, построенный на основе 16 различных образцов маша. Ученые выявили 103 472 структурных варианта (SV), включая делеции, вставки, инверсии и дупликации, многие из которых были пропущены при анализе единственного референсного генома. Эти SV затрагивают гены, участвующие в сроках цветения, развитии семян и устойчивости к болезням.
Связь с агрономическими признаками
Интегрировав пан-геном с полногеномными исследованиями ассоциаций (GWAS), команда определила SV, связанные с массой семян, количеством стручков и сроками созревания. Например, делеция размером 1,2 т.п.н. в промоторе гена VrMYB111 была ассоциирована с увеличением размера семян на 15%. Другой SV рядом с VrFT2a объяснил 22% вариаций сроков цветения среди образцов.
Значение для селекции
Пан-геном предоставляет всесторонний каталог генетического разнообразия, который селекционеры могут использовать для отбора на повышенную урожайность и устойчивость к стрессу. Маш является ключевым источником белка в Южной и Юго-Восточной Азии, мировое производство превышает 7 млн тонн в год. Ресурс доступен через базу данных MungBean Pan-Genome Database.
Что дальше
Команда CCFI планирует расширить пан-геном, включив дикие родственники и дополнительные культурные сорта. Остается неясным, насколько быстро селекционеры смогут воплотить эти открытия в новые коммерческие сорта из-за сложности полигенных признаков.
1 источник
Пан-геном маша выявил более 100 000 структурных вариантов
